De 14 menighedsråd i Køge Kommune sender hvert år mindst ét menighedsrådsmedlem og en præst til det ordinære
Repræsentantskabsmøde. Blandt repræsentanterne vælges et
Forretningsudvalg for ét år ad gangen, bestående af fem medlemmer. Forretningsudvalget har ansvaret for den daglige ledelse af Folkekirkens Skoletjeneste, og der holdes jævnlige møder med de
to religionspædagogiske medarbejdere. Medarbejderne udarbejder
undervisningsmaterialer til kommunens skoler og tilrettelægger
kurser for kommunens lærere og præster. De står endvidere for afviklingen af diverse
film- og teaterarragementer i kommunen i relation til kristendomsfaget.